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苏州惊现奥密克戎变异株新分支,专家:仅凭测序相似程度判断为时过早

发布时间:2022-04-03 所属栏目:

4月2日,苏州市疾控中心在疫情发布会上引见,该市发现奥密克戎BA.1.1进化分支,在多个数据库中均未发现新冠病毒基因组高度同源序列。

国内呈现了此前未有的奥密克戎新变异?这个变异如何呈现?新冠病毒是不是又进化了?疫情还防不防得住?

虽然苏州市疾控中心强调,需求一定时间来剖析比对才干发布进一步信息。但这个新变异仍惹起了普遍关注和不少猜想,登上热搜。带着上述问题,科技日报记者连线采访了国度级数据平台的一位病毒学专家。

仅凭测序类似水平判别为时过早

“‘未发现高度同源的序列’,这样的说法不够科学。”该专家表示,首先,该报道想表述的意义应该是“高度类似的序列”,在生物进化研讨中,“同源”只能被描绘为“是”或者“否”;其次,“高度”的含义不够准确,99.9%和99%都可能被以为是“高度”,但是这两个类似性之间的差别惹起的序列数质变化高达200多个核苷酸;最后,基因组序列变化并不意味着病毒的传播力、感染力、致病力等必然会发作变化,不能仅仅依据序列差别数量判别能否呈现新的盛行变异株,而应进一步剖析序列变异有没有惹起对应氨基酸的变化,这个变异又发作在哪个蛋白上,假如是重要蛋白能否在关键区域。只要这些都研讨分明了,才干够晓得新的毒株可能产生的结果。

能否为“新分支”目前尚不肯定

苏州市疾控中心通报中提到,发现奥密克戎变异株BA.1.1进化分支,是不是阐明曾经变异到一定水平了呢?

“关于新冠病毒的新分支,国际上有不同的定义。”该专家对科技日报记者表示,有的定义比拟粗放、有的比拟细致。学术界有不同的分类办法,设立了不同的规范。

科技日报记者查询文献材料理解到,有学者在剖析了35000多条新冠病毒基因组信息后,在2020年7月提出了动态命名的办法 “PANGO”,其他学者也提出过不同的分类办法。

以较为普遍应用的“PANGO”法为例,该办法规则:一个新的子分支,必需有充沛系统发育证据,证明后代谱系在某个不同天文区域人群中的盛行过程中从祖先谱系向后代谱系的进化过程,也就是说子分支必需有本质性地向前传播。目前而言,仅从一位感染者中检测到该变异序列,难以证明其有本质性地向前传播,因而不一定能被定义为新分支。

“新分支”屡见不鲜 有可能“自生自灭”

“此轮外乡疫情曾经持续了一个多月了,依照新冠病毒的变异速度,呈现2个左右的变异是正常的。”该专家表示,但并不是说新冠病毒一呈现新分支就都会变成凶猛的变异株,只要比拟“顺应”的病毒才有可能存活下来,即使存活下来,也一定会开展成为主流毒株。

“假如你去回溯德尔塔毒株,会发现它有很多分支AY.1、AY.2……AY.133,但最后成为主流的只要几个。”该专家解释,大量的分支在盛行的过程中“自生自灭”。因而,即使是呈现一个新的分支,那也无需过度恐慌,分支最后一定会构成主流,也很少会开展为更具感染力和致病性的毒株。

重要的是大量采集当前各地新冠阳性人员样本停止病毒基因组测序,经过生物信息学办法亲密监测变异状况,及时发现主流毒株,研发有效的疫苗、抗病毒药物和检测试剂,完成对疫情的防控。

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