一 : pcr 为什么要同时用上下游引物
pcr 为什么要同时用上下游引物
可以只用上游,或者下游引物吗?是不是同时用上下游,这样才能P出想要的大小片段.如果只用上游或者下游,会P的过大或者过小
你理解的没错.上下游引物同时用才能特异性扩增中间的那部分片段.
二 : 引物篇:普通PCR 和 QPCR 引物异同点
Q问题: 普通PCR 和 QPCR 引物 是否一样?A 回答:二者的设计原则有相同也有不同;相同处:•序列的查找是一致的;•序列选取应在基因的保守区段;•选取合适的扩增片段大小•避免引物自身或与引物之间形成4个或4个以上连续配对;•避免引物自身形成环状发卡结构;•Tm值在55-65℃,GC含量在40%-60%;•引物之间的TM相差避免超过2℃;•引物的3’端避免出现3个或3个以上连续相同的碱基;不同处: Real time PCR引物•PCR 产物长度;real-time PCR要求在300bp以内,一般首选80-150bp 之间;•多对目的基因同时扩增,文献上查来的引物条件会不同,需要设计尽可能条件一致的引物;•目的基因含量比较低时,需要设计灵敏度比较高的引物;•相对电泳法,Real time PCR灵敏度比较高,对引物的要求更高,引物二聚体要少;熔解曲线要求单一产物;•Real time PCR的目的是进行定量或者相对定量,对扩增的效率有要求;对引物的二级结构要求高;普通PCR 引物:•根据实验的要求不同,长度一般是从150bp到几千bp 不等;•对二级结构要求没有real time PCR 高;•对扩增效率要求不高;•可以选用梯度PCR 仪,选择不同退火温度,对引物退火温度要求不需要一致;验证时不同:引物的特异性(相同点):Ø引物的特异性在使用前用blast 来保证;不同点:real time PCRØ在实验结果中通过熔解曲线来验证;ØPCR的特异性产物峰应与引物报告中的PCR product 相差在两度之内;普通PCR 通过产物的长度,跑条带,来鉴别产物的特异性;Real time PCR 可以通过扩增曲线,熔解曲线分析来鉴别产物的相对量,同时也可以对终产物进行电泳分析,更全面,更科学! 本文标题:pcr引物-pcr 为什么要同时用上下游引物61阅读| 精彩专题| 最新文章| 热门文章| 苏ICP备13036349号-1